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06-202024
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鰻鱺圓環(huán)病毒SYBR Green Ⅰ qPCR檢測方法的建立與應用
摘要:為建立鰻鱺圓環(huán)病毒(Eel circovirus,EeCV)的SYBR GreenⅠ實時熒光定量PCR(qPCR)檢測方法,根據EeCV復制相關蛋白(replication-associated protein, RAP)基因的保守序列設計特異性引物,并評價其靈敏性、特異性、重復性和應用效果。qPCR的閾值循環(huán)數(Cycle threshold value,Ct值)與標準品的拷貝數線性關系良好,且線性范圍廣(1.0×108~102拷貝數/μL);可特異性檢測EeCV,而對鰻鱺皰疹病毒(Anguillid herpesvirus)、豬圓環(huán)病毒(Porcine circovirus)、鴨圓環(huán)病毒(Duck circovirus)無擴增;重復性強,組內和組間變異系數均小于3%;靈敏性高于普通PCR法10倍。且qPCR檢測后發(fā)現,在感染EeCV的鰻鱺體內重要器官均可檢測到EeCV,其中鰓的病毒量顯著高于其他組織;對保存的44份疑似鰻鱺病毒性感染病料進行檢測,陽性檢出率為98%,而普通PCR法的陽性檢出率為73%。


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