摘要：魚類腸道菌群的結(jié)構(gòu)和功能對(duì)其生長發(fā)育起重要作用。丁桂是我國新疆地區(qū)特有的經(jīng)濟(jì)養(yǎng)殖魚類，為評(píng)估野生丁桂和養(yǎng)殖丁桂腸道微生物菌群的結(jié)構(gòu)和差異，以野生丁桂和養(yǎng)殖丁桂作為研究對(duì)象，采用Illumina Miseq高通量測(cè)序方法對(duì)其腸道16S rRNA基因的V3～V4區(qū)進(jìn)行測(cè)序，比較兩種環(huán)境條件下丁桂腸道微生物菌群結(jié)構(gòu)的豐度變化和差異。試驗(yàn)結(jié)果顯示，丁桂腸道微生物的優(yōu)勢(shì)菌群主要為變形菌門、厚壁菌門、放線菌門和擬桿菌門。但在兩種環(huán)境下，其腸道菌群結(jié)構(gòu)存在明顯差異：在門水平下，梭菌門和酸菌門在養(yǎng)殖丁桂中的豐度顯著低于野生丁桂(P<0.05);在屬水平下，乳酸桿菌屬和不動(dòng)桿菌屬在養(yǎng)殖丁桂中的豐度高于野生丁桂,而支原體和黃桿菌屬則顯著低于野生丁桂(P<0.01);在種水平下，洛菲不動(dòng)桿菌在養(yǎng)殖丁桂中的含量顯著高于野生丁桂(P<0.01),而未分類的黃桿菌則顯著低于野生丁桂(P<0.05)。試驗(yàn)結(jié)果表明，由于飼養(yǎng)環(huán)境的改變，野生丁桂和養(yǎng)殖丁桂腸道菌群的組成及豐度出現(xiàn)顯著變化。該結(jié)果可為后續(xù)丁桂腸道微生物的研究和養(yǎng)殖管理提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和參考。
