摘要：病原基因組信息的匱乏是牡蠣病害研究進(jìn)展緩慢的主要原因之一。為鑒定更多牡蠣相關(guān)病毒，基于前期研究獲得的華南沿海多地養(yǎng)殖的香港牡蠣(Crassostrea hongkongensis)病毒組測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控、組裝、物種注釋后，挑選出其中疑似圓環(huán)病毒基因組序列進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建、基因組比較、蛋白結(jié)構(gòu)域分析、三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和病毒豐度分析，在養(yǎng)殖牡蠣體內(nèi)鑒定到了5個(gè)序列完整的新型牡蠣相關(guān)圓環(huán)病毒基因組，且5個(gè)病毒基因組在多個(gè)樣品中存在。結(jié)果顯示，5條病毒序列與已知的圓環(huán)病毒聚類(lèi)在一個(gè)大的分支，說(shuō)明其為圓環(huán)病毒科成員；5條病毒基因組序列均含有一個(gè)復(fù)制酶蛋白基因，且均與節(jié)肢動(dòng)物圓環(huán)病毒復(fù)制酶蛋白序列最為相似；5條序列與另外7條公共數(shù)據(jù)庫(kù)檢索到的序列形成了一個(gè)獨(dú)立的子分支，且該分支的序列來(lái)源多為動(dòng)物相關(guān)樣品?；诮Y(jié)構(gòu)域分析軟件(SMART)鑒定到多數(shù)序列中存在復(fù)制酶的保守結(jié)構(gòu)域。
