摘要：為探究凡納濱對(duì)蝦養(yǎng)殖過程中其腸道和養(yǎng)殖環(huán)境微生物群落的結(jié)構(gòu)及變化,本實(shí)驗(yàn)采用Illumina MiSeq測序平臺(tái),基于16S rRNA基因的測序結(jié)果,對(duì)46和86 d蝦齡的凡納濱對(duì)蝦腸道以及養(yǎng)殖水樣、底泥中的微生物群落進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,86 d時(shí)微生物Shannon-Wiener多樣性指數(shù)顯著高于46 d,水樣中的Shannon-Wiener指數(shù)顯著低于底泥和凡納濱對(duì)蝦腸道;有35個(gè)門、70個(gè)綱、152個(gè)目、274個(gè)科以及420個(gè)屬在水樣、底泥和蝦腸道中均能檢測到,其中蝦腸道和底泥間共有菌類較水樣中更多。微生物群落隨養(yǎng)殖時(shí)間增加發(fā)生變化,46與86 d的差異性門類為放線菌門、綠菌門、絲狀桿菌門、浮霉?fàn)罹T和TM6,相對(duì)豐度隨時(shí)間增加而增高。水樣、底泥和蝦腸道中有相對(duì)固定的優(yōu)勢菌群,在水樣、底泥和蝦腸道中主要的門類均為變形菌門、擬桿菌門和放線菌門,優(yōu)勢綱類為α變形菌綱、β變形菌綱以及放線菌綱,除此以外,蝦腸道與底泥共有的優(yōu)勢綱為δ變形菌綱、γ變形菌綱以及芽單胞菌綱;從目、科、屬的分類水平上看,水樣、底泥和蝦腸道中菌類相對(duì)豐度各異,鮮有明顯重疊的優(yōu)勢菌類,在水樣、底泥和蝦腸道中均為一種未分類的屬占優(yōu)勢地位,水樣中優(yōu)勢屬為hgcIclade,底泥和蝦腸道中優(yōu)勢屬為Ambiguoustaxa。研究結(jié)果進(jìn)一步解釋了蝦腸道和環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)之間的相關(guān)性以及隨蝦齡增長呈現(xiàn)的差異性。
